به گزارش تاس، محققان چینی و آلمانی برای اولین بار ژنوم سیب زمینی را به طور کامل رمزگشایی کردند. این به آنها کمک کرد تا تاریخچه تکاملی این گیاه را کشف کنند و مناطق کلیدی DNA مرتبط با رشد و مقاومت در برابر بیماری را برجسته کنند. اطلاعات در مورد این توسط سرویس مطبوعاتی موسسه آلمانی برای اصلاح نباتات (IPZ) منتشر شده است.
پروفسور Korbinian Schneeberger، پروفسور IPZ گفت: «توالیبندی ژنوم سیبزمینی به ما امکان میدهد تا برنامههای اصلاحی با کارایی بالا را راهاندازی کنیم که گونههای جدیدی را ایجاد میکند که بازده بالا و در عین حال مقاوم در برابر گرمایش جهانی هستند، که در دهههای آینده حیاتی خواهد بود».
بسیاری از بیماری های قارچی و باکتریایی در کشت سیب زمینی و همچنین آفات مختلف مانند سوسک سیب زمینی کلرادو و نماتدها اختلال ایجاد می کنند. دانشمندان و پرورش دهندگان در تلاشند تا با ایجاد انواع جدیدی از سیب زمینی های معمولی و اصلاح شده ژنتیکی با آنها مبارزه کنند.
پروفسور اشنیبرگر و همکارانش در پروژه ای عظیم با هدف تعیین توالی کامل ژنوم سیب زمینی راه حلی بالقوه برای این مشکل ارائه کرده اند. در گذشته، دانشمندان قبلاً سعی کرده بودند این اطلاعات را به دست آورند، اما ساختار بسیار پیچیده ژنوم سیب زمینی مانع از این شد - این ژنوم شامل چهار مجموعه کروموزوم یکسان است که حاوی تعداد زیادی تکرار است.
فناوری ها و الگوریتم های جدید توالی یابی DNA برای تجزیه و تحلیل اطلاعات ژنتیکی به ژنتیک دانان آلمانی و چینی کمک کرد تا این مشکل را برای گونه Otava حل کنند. برای رمزگشایی ژنوم، دانشمندان تعداد زیادی از دانه های گرده را جمع آوری کردند که ماده ژنتیکی آن فقط دو و نه چهار نسخه از کروموزوم ها را شامل می شود.
این رویکرد کار را بسیار ساده کرد، اما در عین حال نیاز به رمزگشایی تعداد بسیار زیادی از قطعات DNA و ترکیب بعدی آنها با استفاده از الگوریتم های کامپیوتری داشت. در نهایت، دانشمندان یک کپی مجازی از ژنوم کامل سیب زمینی را به دست آوردند که شامل تقریباً 3,1 میلیارد "حروف" ژنتیکی - نوکلئوتیدها و حاوی بیش از 38 ژن است.
تجزیه و تحلیل بعدی ساختار آنها تاریخچه تکاملی پیچیده سیب زمینی را نشان داد. دانشمندان دریافته اند که این فرهنگ نسبتاً اخیراً از دو برابر شدن ژنوم در نتیجه همخونی جان سالم به در برده است. علاوه بر این، دانشمندان تفاوتهای غیرمعمولی را در سطح فعالیت نسخههای ژنهای مشابه واقع در کروموزومهای مختلف کشف کردند که به طور بالقوه بر کارایی تلاقی انواع مختلف سیبزمینی تأثیر میگذارد.
دانشمندان امیدوارند این اطلاعات به توسعه گونه های جدید یا اصلاح ژنوم به گونه ای کمک کند که سیب زمینی سریعتر رشد کند، بهتر در برابر سوختگی دیررس و سایر بیماری ها مقاومت کند و همچنین کمتر در معرض عوامل استرس زا قرار گیرد.